Минусы фреймов:
Эстетические: есть очень большая вероятность того, что если пользователь уменьшит размер окна меньше, чем предполагалось дизайнером, и в результате появиться масса полос скролинга.
Логические: пользователь не видит настоящий адрес каждой посещаемой им странички, а только начальный. Кроме того, очень тяжело поставить закладку на действительно нужную страницу.
Навигация. Есть вероятность того, что пользователь все таки умудрится поставить ссылку на страницу, обычно скрытую в куче фреймов. В таком случае пользователь не увидит всего того, что Вы приготовили для него в других фреймах.
Технические. Такие броузеры как IE и NN по разному показывают фреймы. То, что отлично видно 50% посетителей может оказаться недоступным остальным 50%.
Как правило такие к фреймам прибегают, чтобы не вставлять в каждый файл информацию одинаково содержания. Этого можно легко избежать, если использовать серверную часть приложений: SSI или PHP.
Несколько ссылок:
http://www.w3.org/TR/REC-html40-971218/present/frames.html Стандарты фреймов на сервере w3.